Durée
2 journées – 14 heures
// De 9h00 à 17h00
Pédagogie
Effectif : 10 Personnes
Travaux tutorés & Ateliers pratiques
La formation sera sanctionnée par une attestation de formation
Moyens pédagogiques et techniques d’encadrement
Un vidéoprojecteur // Connexion WIFI haut débit // Un support de cours numérique // Un paperboard
Accessibilité
Accessibilité dépendante du site de formation en vos murs
Frais pédagogique
Sur devis
Formateur
Dr G. Perrière
Public concerné
Biologistes (Chercheurs, ingénieurs, étudiants) voulant s’initier à la phylogénie Moléculaire
Prérequis
Etre familiarisé avec les banques de données de séquences
Avoir déjà utilisé au moins un logiciel de bioinformatique
Notions de base en mathématiques et en statistiques
Objectifs / Compétences
de la formation initiation à la phylogénie Moléculaire
- Acquérir les connaissances générales sur les méthodes de recherche de similarités dans les banques
- Savoir identifier des séquences homologues utilisables pour une reconstruction phylogénétique et construire un jeu de données approprié
- Connaître les limites et les biais possibles des méthodes et des modèles
- Pouvoir construire puis interpréter une phylogénie au moyen du programme SeaView
Programme de la formation: Initiation à la phylogénie Moléculaire
Comprendre et savoir utiliser les programmes d’alignement et de recherche de simularités
Alignements simples et multiples
Recherche par profils
Filtrage des alignement
Maîtriser les concepts propres à la phylogénie
Notion d’homologie
Représentation des arbres
Racinement d’un arbre
Acquérir les connaissances de base sur les modèles utilisés en phylogénie
Comprendre et savoir utiliser les méthodes de parcimonie et de distance
Pouvoir évaluer la fiabilité d’une phylogénie au moyen du bootstrap
Utilisation des logiciels BLAST, SeaView, DNApars et BioNJ
Initiation à la phylogénie Moléculaire
Réf : BIF-09
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Depuis 2007, de nombreuses entreprises, PME ou grands groupes de la pharma, font confiance à Biosciences & Co pour former leurs collaborateurs : Techniciens, Ingénieurs et Chercheurs. Par ailleurs, Biosciences & Co forme également de très nombreux agents des EPST tel que le CNRS, l’INRAE, l’INSERM, le CEA, le CIRAD, l’ANSES et les Universités Françaises.
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