Modélisation de la structure 3D des protéines avec le logiciel YASARA

Réf : BIF-41

Télécharger le programme Télécharger le synopsis S'inscrire à la formation

Durée

1 journée – 7 heures
// De 9h00 à 17h00

Pédagogie

Effectif : 10 Personnes
50% de pratique – Exercices d’application

Adaptation au niveau du groupe, aux difficultés rencontrées par certains auditeurs et, dans la mesure du possible, des exemples personnels pourront être pris en compte lors des exercices.
La formation sera sanctionnée par une attestation de formation.

Moyens pédagogiques et techniques d’encadrement

Un vidéoprojecteur // Connexion WIFI haut-débit // Un support de cours numérique // Un paperboard

Accessibilité

Formation accessible au public à mobilité réduite – Adaptation des moyens de la prestation aux personnes en situation de handicap

Frais pédagogique

600 € HT / Académiques : 540 € HT
Déjeuner offert

Formateur

Dr. E. Bettler

Public concerné

Techniciens, ingénieurs, chercheurs et porteurs de projet toutes spécialités confondues – Débutants et intermédiaires

Prérequis

Aucun

Objectifs / Compétences

de la formation modélisation de la structure 3D des protéines avec le logiciel YASARA

  • Retenir les notions de bases de la modélisation moléculaire par homologie
  • Retenir les notions de superposition 3D, de RMSD, d’énergie de conformation
  • Identifier les différentes fonctions/plugins nécessaires du logiciel YASARA
  • Estimer quand une modélisation de protéine est possible
  • Juger des prérequis à une bonne modélisation
  • Rendre compte de la qualité d’un modèle
  • Mettre en pratique les notions vues pour modéliser une protéine
S'inscrire à la formation

Programme de la formation: Modélisation de la structure 3D des protéines avec le logiciel YASARA

Notions de bases sur la modélisation moléculaire

La modélisation par homologie

Les prérequis nécessaires et les conditions pour une bonne modélisation

Présentation et prise en main du logiciel YASARA – Exercice d’application permettant de réaliser son 1er modèle de protéine

Notions sur le choix d’une bonne empreinte pour la modélisation

Importance de l’alignement entre la séquence à modéliser et la séquence de l’empreinte

Insertion de mutations dans la séquence du modèle si besoin

Exercices d’application permettant de réaliser une modélisation en imposant une empreinte et/ou un alignement de séquence modèle/empreinte

Analyse du modèle obtenu

Vue d’ensemble des critères et logiciels permettant de déterminer la qualité du modèle construit (RMSD, énergie…)

Construction manuelle de boucles

Exercices d’application permettant de reprendre les acquis de la journée et de réaliser et analyser une modélisation complète, d’ajouter des boucles manquantes, d’ajouter un ligand…


Warning: Illegal string offset 'url' in /homepages/39/d370308856/htdocs/biosciences/wp-content/themes/understrap-child-1.1.0/loop-templates/FormulaireInscription.php on line 31

Modélisation de la structure 3D des protéines avec le logiciel YASARA

Réf : BIF-41

Pour nous contacter par téléphone

S'inscrire à la formation

    Dernière modification le 1 février 2023 à 10h39