Modélisation via AlphaFold : notions avancées
Réf : BIF-44
Durée
1 journée - 7 heures
// De 9h00 à 17h00
Pédagogie
Effectif : 10 personnes
Adaptation au niveau du groupe, aux difficultés rencontrées par certains auditeurs et, dans la mesure du possible, des exemples personnels pourront être pris en compte lors des exercices
Exercices d'application
La formation sera sanctionnée par une attestation de formation
Moyens pédagogiques et techniques d’encadrement
Un vidéoprojecteur // Connexion WIFI haut-débit // Un support de cours numérique // Un paperboard
Accessibilité
Formation accessible au public à mobilité réduite - Adaptation des moyens de prestation aux personnes en situation de handicap
Frais pédagogique
600€ HT / Académiques : 540€ HT
Déjeuner offert
Formateur
Dr E. BETTLER
Public concerné
Personnels scientifiques, techniques, chercheurs, ingénieurs, techniciens
Prérequis
Aucun
Durée
1 journée - 7 heures
// De 9h00 à 17h00
Pédagogie
Effectif : 10 personnes
Adaptation au niveau du groupe, aux difficultés rencontrées par certains auditeurs et, dans la mesure du possible, des exemples personnels pourront être pris en compte lors des exercices
Exercices d'application
La formation sera sanctionnée par une attestation de formation
Moyens pédagogiques et techniques d’encadrement
Un vidéoprojecteur // Connexion WIFI haut-débit // Un support de cours numérique // Un paperboard
Accessibilité
Accessibilité dépendante du site de formation en vos murs
Frais pédagogique
Sur devis
Formateur
Dr E. BETTLER
Public concerné
Personnels scientifiques, techniques, chercheurs, ingénieurs, techniciens
Prérequis
Aucun
Objectifs / Compétences
De la formation Modélisation via AlphaFold : notions avancées
- Retenir les notions de bases et avancées de la modélisation moléculaire via AlphaFold
- Retenir les notions de pLDDT, DockQ, iPTM, dropout..
- Identifier les différentes options du notebook Colabfold AlphaFold
- Rendre compte de la qualité d’un modèle
- Savoir améliorer la qualité d’un modèle
- Savoir utiliser AlphaFold et Phenix (cristallographie, cryomicroscopie..)
- Mettre en pratique les notions vues pour modéliser une protéine
Programme de la formation: Modélisation via AlphaFold : notions avancées
Notions de bases sur la modélisation moléculaire et notamment la modélisation par alphafold
Présentation et prise en main du webiciel Colabfold AlphaFold
Limites actuelles du logiciel
Exercice d’application permettant de réaliser son 1er modèle de protéine
Comment juger de la qualité d’un modèle ?
Notions sur le choix des options en fonction de la construction d’un monomère ou d’un polymère
Exercices d’application
Combiner AlphaFold et Phenix
Utiliser des données expérimentales pour la construction et/ou l’optimisation d’un modèle AlphaFold
Exercices d’application permettant de reprendre les acquis de la journée
Modélisation via AlphaFold : notions avancées
Réf : BIF-44
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Depuis 2007, de nombreuses entreprises, PME ou grands groupes de la pharma, font confiance à Biosciences & Co pour former leurs collaborateurs : Techniciens, Ingénieurs et Chercheurs. Par ailleurs, Biosciences & Co forme également de très nombreux agents des EPST tel que le CNRS, l’INRAE, l’INSERM, le CEA, le CIRAD, l’ANSES et les Universités Françaises.
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