CRISPR/Cas9 : une rupture en génie génétique
Réf : BMC-26
Durée
2 journées - 14 heures
// De 9h00 à 17h00
Les 19 & 20 juin 2025
Pédagogie
Effectif : 12 personnes
Questionnaire / QCM et exercices pratiques sous forme de Travaux Dirigés
Clarification/reformulation des points problématiques identifiés lors des questions, tours de table, QCM et TD
Lors des TD, accompagnement/explications renforcés. Pour les stagiaires les plus autonomes, conseils au design des outils correspondant à leur propre projet.
La formation sera sanctionnée par une attestation de formation
Moyens pédagogiques et techniques d’encadrement
Un vidéoprojecteur // Connexion WIFI haut-débit // Un support de cours numérique // Un paperboard // Un ordinateur par participant
Accessibilité
Formation accessible au public à mobilité réduite - Adaptation des moyens de prestation aux personnes en situation de handicap
Frais pédagogique
1200€ HT / Académiques : 1080€ HT
Déjeuners offerts
Formateur
Dr S. Markossian et Dr. F. Flamant
Public concerné
Personnels scientifiques et techniques voulant s’initier à la technologie CRISPR/Cas9
Prérequis
Connaitre les bases de la biologie moléculaire (niveau mini bac+2)
Durée
2 journées - 14 heures
// De 9h00 à 17h00
Les 4 & 5 décembre 2025
Pédagogie
Effectif : 12 personnes
Questionnaire / QCM et exercices pratiques sous forme de Travaux Dirigés
Clarification/reformulation des points problématiques identifiés lors des questions, tours de table, QCM et TD
Lors des TD, accompagnement/explications renforcés. Pour les stagiaires les plus autonomes, conseils au design des outils correspondant à leur propre projet.
La formation sera sanctionnée par une attestation de formation
Moyens pédagogiques et techniques d’encadrement
Un vidéoprojecteur // Connexion WIFI haut-débit // Un support de cours numérique // Un paperboard // Un ordinateur par participant
Accessibilité
Formation accessible au public à mobilité réduite - Adaptation des moyens de prestation aux personnes en situation de handicap
Frais pédagogique
1200€ HT / Académiques : 1080€ HT
Déjeuners offerts
Formateur
Dr S. Markossian et Dr. F. Flamant
Public concerné
Personnels scientifiques et techniques voulant s’initier à la technologie CRISPR/Cas9
Prérequis
Connaitre les bases de la biologie moléculaire (niveau mini bac+2)
Durée
2 journées - 14 heures
// De 9h00 à 17h00
Pédagogie
Effectif : 12 personnes
Questionnaire / QCM et exercices pratiques sous forme de Travaux Dirigés
Clarification/reformulation des points problématiques identifiés lors des questions, tours de table, QCM et TD
Lors des TD, accompagnement/explications renforcés. Pour les stagiaires les plus autonomes, conseils au design des outils correspondant à leur propre projet.
La formation sera sanctionnée par une attestation de formation
Moyens pédagogiques et techniques d’encadrement
Un vidéoprojecteur // Connexion WIFI haut-débit // Un support de cours numérique // Un paperboard // Un ordinateur par participant
Accessibilité
Accessibilité dépendante du site de formation en vos murs
Frais pédagogique
Sur devis
Formateur
Dr S. Markossian et Dr. F. Flamant
Public concerné
Personnels scientifiques et techniques voulant s’initier à la technologie CRISPR/Cas9
Prérequis
Connaitre les bases de la biologie moléculaire (niveau mini bac+2)
Objectifs / Compétences
de la formation CRISPR/Cas9 : une rupture en génie génétique
- Comprendre les mécanismes fondamentaux de l’édition génomique
- Distinguer les différentes utilisations de l’édition génomique
- Identifier les limites techniques de la méthode et déterminer les contrôles nécessaires à sa mise en œuvre
- Mettre en place une stratégie expérimentale d’édition génomique adaptée au projet : choisir entre la voie NHEJ ou HDR ; connaitre les différentes étapes d’une édition génomique : design des outils, comment et sous quelle forme introduire les différents composants dans la cellule, comment sélectionner et génotyper les cellules
- Optimiser le design de l’ARN guide et de la matrice de réparation éventuelle, choisir la nucléase adaptée : acquérir des outils et connaissances afin d’optimiser le choix et le design des différents composants
- Concevoir les expériences de génotypage et interpréter les résultats : identifier les mutations attendues, prendre en compte les mutations « off target »
- Acquérir un regard critique afin de suivre les innovations dans le domaine de l’édition génomique
Programme de la formation: CRISPR/Cas9 : une rupture en génie génétique
Présentation générale de la méthode CRISPR/cas9
Aperçu général des méthodes du génie génétique
CRISPR/Cas9 : détourner une défense bactérienne naturelle pour l’édition génomique
Déclinaison de la méthode pour des utilisations variées, les voies NHEJ et HDR
Les différentes étapes du protocole d’édition génomique
L’avènement de CRISPR/Cas9 : pourquoi c’est une révolution
Mise en œuvre de la méthode
Paramètres définissant la spécificité de l’édition génétique
Prise en compte des mutations hors-cible « off-target »
Paramètres définissant l’efficacité de l’édition génétique
Prédictions bioinformatiques et optimisation de la conception des ARN guides
Mise en application 1 : Générer des mutations « indels » via la voie NHEJ, application à l’invalidation génique (KO)
TD : design d’un projet de KO. Recherche des séquences d’intérêt. Présentation d’un logiciel gratuit permettant le traitement des séquences (simulation des mutations, conséquences au niveau protéique). Considérations pratiques pour le design de l’ARN guide, présentation d’un outil performant et gratuit de design. Choix des amorces de génotypage. Présentation d’un outil gratuit d’évaluation des indels générés. Application à l’analyse de chromatogrammes de séquence fournis.
La réalisation de modifications génétiques précises via la voie HDR : accent sur les matrices de réparation de type oligonucléotide (« ssODN »). Optimisation de leur conception.
Mise en application 2 : Réaliser des modifications précises via la voie HDR et une matrice ssODN. Application à la réalisation de mutations ponctuelles
TD : design d’un projet de mutations ponctuelles mimant une maladie génétique humaine. Considérations pratiques pour le design de l’ARN guide lors de l’utilisation de la voie HDR. Design de la matrice ssODN. Stratégies de génotypage PCR pour le screen de mutations ponctuelles. Présentation d’un second outil gratuit d’identification des indels et des mutations ponctuelles. Application à l’analyse de chromatogrammes de séquence fournis.
Les limites actuelles de la méthode CRISPR/Cas9.
Les approches pour favoriser la mutagénèse dirigée (voie HDR) par rapport à l’édition génomique aléatoire (voie NHEJ).
Autres nucléases et versions modifiées de Cas9
Les variants de la nucléase Cas9 (nickases, dCas9, variants avec spécificité accrue…)
Les nucléases alternatives issues d’autres souches bactériennes
Utilisation de variants de Cas9 comme plateforme de développement : base-editing, prime-editing, CRISPRa / CRISPRi.
CRISPR/Cas9 : une rupture en génie génétique
Réf : BMC-26
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