Principes et applications des nouvelles méthodes de séquençage à haut-débit (NGS) : choisir la technologie adaptée à son projet

Réf : BMC-18

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Durée

1,5 journées – 10,5 heures
13.30 - 17.00 Jour 1
9.00 - 17h00 Jour 2
Les 11 & 12 mai 2023

Pédagogie

Effectif : 12 Personnes
Mise en situation et exercices pratiques
La formation sera sanctionnée par une attestation de formation

Moyens pédagogiques et techniques d’encadrement

Un vidéoprojecteur // Connexion WIFI haut-débit // Un support de cours numérique // Un paperboard

Accessibilité

Formation accessible au public à mobilité réduite – Adaptation des moyens de la prestation aux personnes en situation de handicap

Frais pédagogique

900 € HT / Académiques : 830 € HT
Déjeuner offert

Formateur

Mme S. Hughes & M. B. Gillet

Public concerné

Techniciens, ingénieurs, chercheurs et porteurs de projet toutes spécialités confondues – Débutants et intermédiaires

Prérequis

Compétence de base en Biologie Moléculaire – Niveau L2

Objectifs / Compétences

de la formation principes et applications des nouvelles méthodes de séquençage à haut-débit (NGS) : choisir la technologie adaptée à son projet

  • Différencier les techniques de séquençage à haut-débit: distinguer et comparer les différentes technologies NGS
  • Acquérir les principes de fonctionnement des différentes technologies NGS pour critiquer, différencier, identifier, et choisir la meilleure technologie en fonction du besoin
  • Connaitre les différentes applications possibles des méthodes NGS et leurs spécificités.
  • Définir, justifier et recommander une technologie NGS en fonction de l’application souhaitée
  • Différencier les grandes étapes méthodologiques, avant et après séquençage, pour mettre en oeuvre son projet de séquençage
  • Améliorer, concevoir et appliquer de nouveaux protocoles adaptés à ses projets
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Programme de la formation: Principes et applications des nouvelles méthodes de séquençage à haut-débit (NGS) : choisir la technologie adaptée à son projet

Les méthodes de séquençages : principes

Présentation des différentes méthodes de séquençage à haut-débit

Principe et fonctionnement

Capacité de séquençage

Comparatif des différences méthodes, forces et faiblesses

Les technologies de demain

De l’échantillon à la séquence : les grandes étapes méthodologiques

Préparation des échantillons

  • Les différentes étapes clés méthodologiques
  • Garantir la qualité des données de séquençage
  • Penser son expérimentation
  • La production des échantillons biologiques
  • Extraction et purification des acides nucléiques

Captures et enrichissement

  • Capture d’hybrides
  • Amplification PCR
  • Immunoprécipitation

Autres approches méthodologiques

  • Construction des différents types de banques
  • Les étapes clés
  • Construction des banques à ADN
  • Construction des banques à partir d’ARN
  • Veille et innovation technologique

Préparation de banques et séquençage sur plateforme Ion Torrent PGM : exemple

L’analyse des données de séquençage

Introduction

La production des données

L’analyse

Les bases de données

Conclusions

Les différentes applications NGS : quelle méthode choisir en fonction de mon application ?

Introduction

La génomique structurale

La génomique fonctionnelle

Métagénomique et environnement

Conclusions

Bilan et questions


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Principes et applications des nouvelles méthodes de séquençage à haut-débit (NGS) : choisir la technologie adaptée à son projet

Réf : BMC-18

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    Dernière modification le 1 février 2023 à 10h39