Durée

2 journées - 14 heures
// De 9h00 à 17h00
Les 16 & 17 octobre 2025

Pédagogie

Effectif : 12 personnes
Les applications décrites seront des cas concrets réalisés sur la plateforme de génomique et microgénomique profilexpert
Exercices d’application
Evaluation réalisée selon un QCM sur les connaissances de base (50%) et sur les connaissances spécifiques (50%)
La formation sera sanctionnée par une attestation de formation

Moyens pédagogiques et techniques d’encadrement

Un vidéoprojecteur // Connexion WIFI haut-débit // Un support de cours numérique // Un paperboard

Accessibilité

Formation accessible au public à mobilité réduite - Adaptation des moyens de prestation aux personnes en situation de handicap

Frais pédagogique

1200€ HT / Académiques : 1080€ HT
Déjeuners offerts

Formateur

Dr J. Lachuer

Public concerné

Biologistes (Chercheurs, ingénieurs, étudiants) souhaitant s'initier aux technologie de séquençage à l'échelle de la cellule unique : Single Cell

Prérequis

Niveau de Biologie Moléculaire équivalent à Bac+2

Durée

2 journées - 14 heures
// De 9h00 à 17h00

Pédagogie

Effectif : 12 personnes
Les applications décrites seront des cas concrets réalisés sur la plateforme de génomique et microgénomique profilexpert
Exercices d’application
Evaluation réalisée selon un QCM sur les connaissances de base (50%) et sur les connaissances spécifiques (50%)
La formation sera sanctionnée par une attestation de formation

Moyens pédagogiques et techniques d’encadrement

Un vidéoprojecteur // Connexion WIFI haut-débit // Un support de cours numérique // Un paperboard

Accessibilité

Accessibilité dépendante du site de formation en vos murs

Frais pédagogique

Sur devis

Formateur

Dr J. Lachuer

Public concerné

Biologistes (Chercheurs, ingénieurs, étudiants) souhaitant s'initier aux technologie de séquençage à l'échelle de la cellule unique : Single Cell

Prérequis

Niveau de Biologie Moléculaire équivalent à Bac+2

Objectifs / Compétences

de la formation Single Cell : génomique de la cellule unique

Connaître les différentes technologies permettant d’isoler et de traiter les cellules à l’échelle unique

Connaître les technologies d’amplification d’ARN ou ADN à partir de lysat cellule unique.

Connaître les technologies de scRNA seq (3’end ou full length) pour les analyse d’ARN. Utilisation des UMI (unique molecular identifier)

Calculer les profondeurs de séquençage nécessaire pour une étude sur cellule unique et décider du taux de multiplexage à utiliser

Savoir apprécier la qualité du séquençage (Q30, score d’alignement, taux d’erreur)

S'inscrire à la formation

Programme de la formation: Single Cell : génomique de la cellule unique

Présentation de l’approche single cell et des différentes étapes pour la réalisation d’une analyse en cellule unique

Dissociation des tissus

Fixation des cellules

Marquage

Compartimentalisation des cellules

Amplification des acides nucléiques

Les technologies de séparation de cellules et d’amplification d’ADN ou ARN

Séparation des cellules

  • Microfluidique
  • Nano gouttelettes
  • Capture laser
  • Filtre
  • Cages électriques…

Amplification d’ADN ou ARN à partir du lysat cellulaire

Les technologies d’analyse

PCR/NGS fragments courts et fragments longs

Application à l’étude du transcriptome

Expression différentielle

Analyse de variants

ARN fusion

Application à l’analyse du génome

Whole genome sequencing

Whole exome

ATAC-seq…

Application à l’étude du méthylome par Reduced Representation Bisulfite Sequencing (RRBS)

Analyse multi-omique sur cellule unique

Introduction aux méthodes d’analyse bioinformatique

Discussion sur les projets des auditeurs

Single Cell : génomique de la cellule unique

Réf : BMC-25

Pour nous contacter par téléphone

S'inscrire à la formation

    Dernière modification le 20 juin 2025 à 12h29