Cytométrie en flux : Analyses des données multiparamétriques
Réf : BMC-41
Durée
2 journées – 14 heures
// De 9h00 à 17h00
Les 12 & 13 octobre 2023
Pédagogie
Effectif : 8 personnes
Travaux pratiques et analyses de jeux de données
La formation sera sanctionnée par une attestation de formation
Moyens pédagogiques et techniques d’encadrement
Un vidéoprojecteur // Connexion WIFI haut-débit // Un support de cours numérique // Un paperboard // Un ordinateur par apprenant
Accessibilité
Formation accessible au public à mobilité réduite – Adaptation des moyens de la prestation aux personnes en situation de handicap
Frais pédagogique
1200 € HT / Académiques : 1080 € HT
Déjeuners offerts
Formateur
M. A. Corneau
Public concerné
Chercheurs, Ingénieurs, techniciens
Prérequis
Des connaissances de base en analyse de données et de FlowJo en cytométrie sont requises
Durée
2 journées - 14 heures
// De 9h00 à 17h00
Pédagogie
Effectif : 8 personnes
Travaux pratiques et analyses de jeux de données
La formation sera sanctionnée par une attestation de formation
Moyens pédagogiques et techniques d’encadrement
Un vidéoprojecteur // Connexion WIFI haut-débit // Un support de cours numérique // Un paperboard // Un ordinateur par apprenant
Accessibilité
Accessibilité dépendante du site de formation en vos murs
Frais pédagogique
Sur devis
Formateur
M. A. Corneau
Public concerné
Chercheurs, Ingénieurs, techniciens
Prérequis
Des connaissances de base en analyse de données et de FlowJo en cytométrie sont requises
Objectifs / Compétences
de la formation cytométrie en flux : Analyses des données multiparamétriques
- Connaitre et appréhender l’analyse des données multiparamétriques en utilisant les logiciels Cytobank, FlowJo, Tableau
- Mettre en évidence la complémentarité des logiciels
- Créer un pipeline d’analyse pour répondre à une question biologique
Programme de la formation: Cytométrie en flux : Analyses des données multiparamétriques
Les différentes approches analytiques de haute dimension
Analyses supervisées manuelles : avantages / inconvénients
Analyses non supervisées automatiques :
- Réduction de dimension
- Analyse par cluster
Comparatif cytométrie en flux vs cytométrie de masse
Pratique : Discussion sur les acquis et les bases de chaque participant et présentation générale des différents algorithmes abordés au cours de la formation
SPADE
Prise en main de Cytobank
Réalisation d’un arbre SPADE sur Cytobank
Analyse et validation d’un arbre SPADE avec SPADEVizr
Exploitation des données SPADE sur Tableau
Pratique : Analyse d’un jeu de données (masse et ou flux) en utilisant SPADE
Analyse booléenne
Prise en main de FlowJo
Réalisation des gates booléennes sur FLowJo
Exploitation des données de gates booléennes sur Tableau
Pratique : Analyse d’un jeu de données (masse et ou flux) en utilisant les booléennes
viSNE
Réalisation d’une analyse viSNE sur Cytobank
Analyse d’une empreinte viSNE
Gating automatique du viSNE et analyse en heatmap avec SPADEVizr
Pratique : Analyse d’un jeu de données (masse et ou flux) en utilisant viSNE
hSNE
Prise en main de Cytosplore
Réalisation d’une analyse hSNE sur Cytosplore
Analyse des clusters hSNE par heatMap
Pratique : Analyse d’un jeu de données (masse et ou flux) en utilisant cytosplore
Citrus
Réalisation d’une analyse Citrus sur Cytobank
Présentation et décryptage du rendu Citrus
Pratique : Analyse d’un jeu de données (masse et ou flux) en utilisant Citrus
Equipement
Logiciels d’analyse FlowJo, Tableau et Cytobank
Cytométrie en flux : Analyses des données multiparamétriques
Réf : BMC-41
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