Modélisation de la structure 3D des protéines via le web service Alphafold
Réf : BIF-41
Durée
1 journée - 7 heures
// De 9h00 à 17h00
Pédagogie
Effectif : 10 personnes
50% de pratique – Exercices d’application
Adaptation au niveau du groupe, aux difficultés rencontrées par certains auditeurs et, dans la mesure du possible, des exemples personnels pourront être pris en compte lors des exercices
La formation sera sanctionnée par une attestation de formation
Moyens pédagogiques et techniques d’encadrement
Un vidéoprojecteur // Connexion WIFI haut-débit // Un support de cours numérique // Un paperboard // Un ordinateur par participant
Accessibilité
Accessibilité dépendante du site de formation en vos murs
Frais pédagogique
Sur devis
Formateur
Dr E. Bettler
Public concerné
Personnels scientifiques, techniques, chercheurs, ingénieurs, techniciens
Prérequis
Avoir des compétences en Biochimie des protéines permettant de comprendre la structure des protéines : de sa séquence à sa structure 3D
Objectifs / Compétences
de la formation modélisation de la structure 3D des protéines à l'aide d'AlphaFold
Rechercher et visualiser un modèle AlphaFold déjà existant
Utiliser ChimeraX pour analyser un modèle AlphaFold
Programme de la formation: Modélisation de la structure 3D des protéines via le web service Alphafold
Rappels de notions de bases sur la modélisation moléculaire
Rappel sur la modélisation via AlphaFold
Présentation et prise en main du logiciel ChimeraX
Utilisation d'Alphafold via ChimeraX
Compréhension des paramètres de modélisation (monomère, complexe, impact sur la qualité des modèles...)
Comment analyser des modèles générés par AlphaFold
Exercices d’application permettant de réaliser et d'analyser son 1er modèle de protéine
Les différents développements autour d'AlphaFold
Modélisation de la structure 3D des protéines via le web service Alphafold
Réf : BIF-41
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